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Table 1 Patient samples used for this study

From: Colorectal cancer progression to metastasis is associated with dynamic genome-wide biphasic 5-hydroxymethylcytosine accumulation

CRC case

Dukes stage

Available samples

AITAC

Sex

Age

Mass Spec

hMeDIP Seq

NC

TC

LT

NL

NL

37

C1

y

y

n

n

 

Male

Median age 73 (range 57 – 81)

y

n

44

 

y

y

n

n

 

Male

y

n

51

D

y

y

y

y

0.86

 

y

y

52

D

y

y

y

y

0.84

 

y

y

53

D

y

y

y

y

0.83

 

y

y

55

D

n

n

y

y

0.84

 

y

y

56

C2

y

y

y

n

 

Female

y

n

57

D

y

y

y

n

  

y

n

58

C2

y

y

y

n

  

y

n

59

C1

y

y

y

n

 

Female

y

n

60

 

y

y

y

n

  

y

n

49

D

n

y

y

y

0.84

Male

y

y

45

 

y

y

n

n

 

Female

y

n

48

 

y

y

n

n

 

Female

y

n

24

 

y

y

n

n

 

Male

y

n

35

C1

y

y

n

n

 

Male

y

n

N = 16

 

N = 14

N = 15

N = 10

N = 5

  

All cases MSI negative

  1. y Yes, n No. Blank cells information not available, AITAC is a measure of tumour purity
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BMC Biology

ISSN: 1741-7007

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